Dawna wieś po lewej stronie Wisły, obecnie w północno-zachodniej części miasta Krakowa, około 7 km od jego centrum, nad potokiem Sudoł, przy starym trakcie przez Będzin na Śląsk (dzisiejsza ulica Władysława Łokietka), sąsiadująca z leżącymi do dziś poza granicą Krakowa Modlnicą z Modlniczką, Pękowicami i Zielonkami, dalej z Prądnikiem Białym, Krowodrzą (od 1910 roku z Krakowem) i Bronowicami Wielkimi.
W najstarszej znanej wzmiance, pochodzącej z 1389 roku, nazwa wsi została zapisana w brzmieniu Tanye. W innych dawnych zapiskach w postaciach: Thanye (1451), Thanie (1470). Nazwa wsi odosobowa, związana z imieniem „Tan” („Than”).
Wieś nieprzerwanie przez wieki należała do parafii pw. Narodzenia Najświętszej Maryi Panny w Zielonkach. W godle pieczętnym znanym z połowy XIX wieku obiekt gospodarczy, prawdopodobnie suszarnia wiejska, na pieczęciach z okresu II Rzeczypospolitej orzeł w kształcie jak godło państwowe.
Tonie uzyskały lokację na prawie niemieckim w 1389 roku, za czasów króla Władysława Jagiełły. Wytyczono wówczas centrum w rejonie dzisiejszej ulicy Władysława Łokietka z południowej strony jej skrzyżowania z obecnymi ulicami Gaik i Na Zielonki oraz dokonano niwowego rozłogu pól. W połowie XIX wieku odnotowywano nazwy pól i rejonów wsi: Mostki/ Suche Łąki, Mostki/Piaski, Glinki/Podechruście, Kacorów/Kaczerówka.
Historycznie wieś była własnością duchowną – w 1224 roku archidiakon krakowski Mikołaj Mikuła podarował ją kapitule krakowskiej i w jej rękach pozostała przez wieki. Około połowy XV wieku dzierżawił Tonie kanonik krakowski Jakub z Dębna. We wsi znajdował się wówczas dwór kapitulny z folwarkiem (między dzisiejszymi ulicami Władysława Łokietka i Gospodarską). Po sekularyzacji wieś otrzymał w 1820 roku w wieczystą dzierżawę generał Franciszek Paszkowski. W ramach Twierdzy Kraków powstał tu fort Tonie, przebudowany w 1910 roku na pancerny.
Przed trzecim rozbiorem gromada Tonie należała do powiatu krakowskiego, po roku 1795 znalazła się jako gmina w austriackim cyrkule krakowskim. W Księstwie Warszawskim Tonie stanowiły gminę, w 1815 roku weszły w granice Rzeczypospolitej Krakowskiej jako gromada w składzie gminy obwodowej Modlnica, od roku 1838 dystryktu Balice. W roku 1846 wieś powróciła jako gromada (od 1856 roku gmina) pod zabór austriacki. W okresie autonomii galicyjskiej, od 1866 roku, wieś miała nadal status jednowioskowej gminy (gminy jednostkowej) w ramach powiatu krakowskiego. To gminne usytuowanie Toń przetrwało do roku 1933. W 1934 roku dotychczasową gminę Tonie przekształcono w gromadę w ramach wielowioskowej gminy zbiorczej Zielonki.
W roku 1941 znajdujące się w okupacyjnym departamencie i powiecie krakowskim Generalnego Gubernatorstwa Tonie (liczące wówczas 5,47 km² i 1996 mieszkańców) włączone zostały do granic Krakowa, do jego VII obwodu administracyjnego, jako XXXVII dzielnica katastralna miasta.
Obecnie tereny tej dawnej wsi stanowią część dzielnicy samorządowej IV Prądnik Biały.
Ze Słownika geograficznego z lat 1880–1902:
Tonie, przez wieś idzie droga z Krakowa do komory cłowej w Giebułtowie. Ma 100 domów i 573 mieszkańców, 555 rzymsko-katolickich i 18 izraelitów. Szkoła ludowa. Za czasów Długosza stał tu dwór kapitulny, przy nim folwark w 3 kawałkach; z 12 łanów płacili kmiecie po grzywnie czynszu i dawali po 30 jaj i 2 kapłony. Z łanu robili 3 dni tygodniowo przez cały rok. Karczma z rolą przynosiła 7 grzywien czynszu, z 6 zagrodników płaciło 3-ch po 10 skotów, 3-ch po 14 groszy i odrabiali dzień w tygodniu. Zagrodnicy i komornicy obowiązani byli do podwójnej powaby [dodatkowej robocizny].
(1847) Odciski pieczęci urzędowych Toń z lat 1847, 1859 i 1923 oraz odcisk w wosku pieczęci kapituły krakowskiej, długotrwałego właściciela wsi Tonie; przedstawia tarczę z trzema koronami, ponad nią dwie półpostaci: św. Stanisława z pastorałem i św. Wacława z proporcem, w otoku napis: S[IGILLUM] MAIVS CAPITVLI ECCE CRACOVIENSIS (Archiwum Narodowe w Krakowie, sygn. WM 562, s. 1144; sygn. 29/456/126, nlb.; sygn. PUZKr 59, nlb.; sygn. perg. 676)(1859) Odciski pieczęci urzędowych Toń z lat 1847, 1859 i 1923 oraz odcisk w wosku pieczęci kapituły krakowskiej, długotrwałego właściciela wsi Tonie; przedstawia tarczę z trzema koronami, ponad nią dwie półpostaci: św. Stanisława z pastorałem i św. Wacława z proporcem, w otoku napis: S[IGILLUM] MAIVS CAPITVLI ECCE CRACOVIENSIS (Archiwum Narodowe w Krakowie, sygn. WM 562, s. 1144; sygn. 29/456/126, nlb.; sygn. PUZKr 59, nlb.; sygn. perg. 676)(1923) Odciski pieczęci urzędowych Toń z lat 1847, 1859 i 1923 oraz odcisk w wosku pieczęci kapituły krakowskiej, długotrwałego właściciela wsi Tonie; przedstawia tarczę z trzema koronami, ponad nią dwie półpostaci: św. Stanisława z pastorałem i św. Wacława z proporcem, w otoku napis: S[IGILLUM] MAIVS CAPITVLI ECCE CRACOVIENSIS (Archiwum Narodowe w Krakowie, sygn. WM 562, s. 1144; sygn. 29/456/126, nlb.; sygn. PUZKr 59, nlb.; sygn. perg. 676)(1583) Odciski pieczęci urzędowych Toń z lat 1847, 1859 i 1923 oraz odcisk w wosku pieczęci kapituły krakowskiej, długotrwałego właściciela wsi Tonie; przedstawia tarczę z trzema koronami, ponad nią dwie półpostaci: św. Stanisława z pastorałem i św. Wacława z proporcem, w otoku napis: S[IGILLUM] MAIVS CAPITVLI ECCE CRACOVIENSIS (Archiwum Narodowe w Krakowie, sygn. WM 562, s. 1144; sygn. 29/456/126, nlb.; sygn. PUZKr 59, nlb.; sygn. perg. 676)Dokument wydany w 1389 roku w Niepołomicach, mocą którego król Władysław [ Jagiełło] przeniósł wieś kościoła katedralnego krakowskiego Tonie z prawa polskiego na prawo magdeburskie – oraz powiększenie zapisu nazwy wsi „Tonie” (Archiwum Krakowskiej Kapituły Katedralnej, sygn. perg. 204)Dokument wydany w 1451 roku w Krakowie, w którym Jakub z Żórawicy, doktor dekretów i kanonik krakowski, sędzia w sprawie o dziesięcinę snopową ze wsi Tonie (będącej własnością kapituły krakowskiej) między Janem z Mochowa, plebanem w Zielonkach, a Stanisławem z Sobniowa, proboszczem trydenckim i kanonikiem krakowskim, posiadaczem tej wsi, orzekł, że dziesięcina ta należy się kapitule krakowskiej – oraz powiększenie zapisu nazwy wsi „Tonie” (Archiwum Krakowskiej Kapituły Katedralnej, sygn. perg. 441)